北京基因组所（国家生物信息中心）相助揭示肾癌和癌栓肿瘤微情况差别
肾癌伴癌栓生长是肾癌恶性特征之一。约10%-30%晚期肾癌患者合并肾静脉或下腔静脉癌栓。未经治疗的肾癌癌栓患者自然病程短，预后差。根治性肾切除及下腔静脉癌栓取出术可有效改善预后，但手术难度大，围手术期并发症多。虽然目前术前新辅助治疗可有效缩小肿瘤体积，降低手术难度及危害。但多项临床研究发明肾癌和配对癌栓对同种治疗计划差别较大。而基于bulk组学测序剖析找到差别有限。因此亟需提高对肾癌和癌栓的深入认识，解析癌栓爆发生长机制，为患者提供越发有效的新辅助治疗计划。
2022年3月31日，pg电子官网（国家生物信息中心）慈维敏团队和北京大学第三医院泌尿外科马潞林团队相助，深入解析肿瘤组织和配对癌栓组织的肿瘤生态系统。该研究通过全景式地刻画肾透明细胞癌原发肿瘤和癌栓的肿瘤微情况差别，为进展期肾癌治疗和缩减癌栓提供潜在治疗通路及靶点。别的，该研究还发明组织驻留型CD8+T细胞可作为潜在肾癌免疫治疗标记物，进一步为肾癌和癌栓免疫治疗提供理论依据。该研究以“Decoding the multicellular ecosystem of vena caval tumor thrombus in clear cell renal cell carcinoma by single-cell RNA sequencing”为题，宣布在Genome Biology 杂志。
该研究收集了肾透明细胞癌癌旁、原发肿瘤和癌栓组织来源的共120,000多个细胞。通过单细胞转录组测序剖析，研究团队发明组织驻留型CD8+T细胞在癌栓中显著富集。通过整合CheckMate 025 PD-1免疫治疗行列，证实组织驻留型T细胞品貌和PD-1免疫治疗敏感性相关。以上结果提示免疫治疗对癌栓可能越发有效。别的研究团队还发明癌栓组织中肿瘤细胞、巨噬细胞、内皮细胞、成纤维细胞内胞外基质重塑相关通路均显著增强；通过细胞和细胞间互作剖析，进一步明确了肿瘤-间质相互作用与透明肾细胞癌患者生存期降低显著相关。以上研究结果为晚期肾癌缩减癌栓的新辅助治疗提供潜在治疗靶点，为靶向细胞外基质的治疗提供了理论基础。
北京大学第三医院泌尿外科主任医师马潞林教授、pg电子官网北京基因组所（国家生物信息中心）慈维敏研究员、北京大学第三医院泌尿外科主任医师刘承教授为本文的配合通讯作者。慈维敏研究组副研究员史悦、在读博士生张琪、北京大学第三医院泌尿外科副主任医师毕海和病理科医师陆敏为本文的配合第一作者。该研究获得中科院战略先导科技专项、国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目资助，以及pg电子官网北京基因组所（国家生物信息中心）杨运桂研究员、赵永良研究员、北京大学白凡教授等众多老师的指导与支持。
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单细胞水平解析肾透明细胞癌和癌栓肿瘤微情况差别
