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基因组所开发LncRNAWiki数据库加入国际RNA数据库联盟(RNAcentral)

  近期,由基因组所开发的长非编码RNA研究领域特色数据库LncRNAWiki被国际RNA数据库联盟(RNAcentral)收录。近些年长非编码RNA成为国际研究的新热点,与人类癌症、神经系统等疾病爆发密切相关,在疾病诊疗方面体现出了潜在的重大应用价值。长非编码RNA的数量与种类均快速地增长,大宗相关研究不绝富厚着我们对长非编码RNA功效与作用机制的认识。与此同时,长非编码RNA相关的数据库也在不绝增长。2014年,基因组所生命与健康大数据中心章张研究员领导的科研团队接纳Wiki技术开发了基于群体审编(Community Curation)的人类长非编码RNA知识库LncRNAWiki,该知识库作为一个信息富厚的人类长非编码RNA知识库受到了国际RNA联盟(RNAcentral)的关注,相关研究人员也将应邀加入由其举办的年度联盟集会。 

  LncRNAWiki整合了来自于Gencode、LNCipedia、NONCODE、lncRNAdb的十万多条人类长非编码RNA序列及信息,并凭据基因组位置对长非编码RNA进行分类。利用Wiki系统的优势,建立多人协同注释的结构与模式,凭据加入人员的编辑数量与质量,对加入人员的孝敬进行量化打分,且凭据分值巨细给予作者身份,以此增进长非编码RNA研究领域科研人员配合完善LncRNAWiki的相关信息和数据更新。相关结果于2014年11月在国际生物信息学领域期刊《Nucleic Acids Research》在线宣布后,该研究团队继续重点收集了有文献报道的人类长非编码RNA,并进行了人工编辑与注释。目前LncRNAWiki共收录719个文献报道的人类长非编码RNA,其中290个与癌症等疾病相关,同时还开发了相应的算法对长非编码RNA编码的小卵白或短肽进行预测,共获得九千多个潜在的由长非编码RNA编码的小卵白或短肽。 

  LncRNAWiki的后续事情仍将重点解析已知的人类长非编码RNA,确保有功效报道的人类长非编码RNA的实时收集与注释�;谑笛橹ぞ萆钊胙芯坑虢馕龀し潜嗦�RNA的功效与作用机制,同时对长非编码RNA的序列特征进行深度挖掘及注释。随着该项事情的不绝深入与完善,将对科研人员越发全面的研究和掌握疾病爆发生长的机制机理打下坚实基础。 

  PG电子·(中国)官方网站 

  数据库链接:http://lncrna.big.ac.cn 

    RNAcentral链接:http://rnacentral.org/

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